鰱鳙魚基因組進(jìn)化與物種形成研究取得進(jìn)展

鰱鳙魚是典型的東亞特有鯉科魚類, 在我國(guó)是最大的經(jīng)濟(jì)魚類養(yǎng)殖群體, 為我國(guó)提供了大量的優(yōu)質(zhì)水產(chǎn)蛋白資源。有趣的是，“胖頭魚”等亞洲鯉魚作為中國(guó)暢銷美食，在美國(guó)卻有另一番景象。上個(gè)世紀(jì)70年代，美國(guó)的很多水域都會(huì)出現(xiàn)雜草和寄生蟲，便從我國(guó)引進(jìn)了不少鰱、鳙魚等（與草魚、鯉魚一起被稱亞洲鯉魚）來(lái)解決這些麻煩，由于沒有天敵，又不是當(dāng)?shù)氐氖秤敏~類，它們反而演變成入侵物種，泛濫成災(zāi)。

近日，中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所研究員何舜平團(tuán)隊(duì)等在Molecular Ecology Resources在線發(fā)表了題為Whole genome sequencing of silver carp (Hypophthalmichthys molitrix) and bighead carp (Hypophthalmichthys nobilis) provide novel insights into their evolution and speciation的研究論文。研究人員利用短讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)，結(jié)合遺傳圖譜輔助掛載染色體的組裝策略，獲得連續(xù)性較好、準(zhǔn)確度高的染色體水平的鰱魚和鳙魚基因組；同時(shí)對(duì)鰱魚20個(gè)野生樣本（珠江7個(gè)，黑龍江4個(gè)和長(zhǎng)江9個(gè)），鳙魚22個(gè)野生樣本（珠江8個(gè)，黑龍江4個(gè)和長(zhǎng)江10個(gè)）進(jìn)行群體重測(cè)序分析。該研究揭示了東亞鯉科魚類的進(jìn)化歷史，并進(jìn)一步探討了鰱魚、鳙魚物種形成，群體分化的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。

研究分析發(fā)現(xiàn)，包括鰱魚、鳙魚和草魚、團(tuán)頭魴在內(nèi)的東亞鯉科魚類在920萬(wàn)年前左右分化出來(lái)，東亞鯉科魚類在形成之后，物種快速進(jìn)化并適應(yīng)新環(huán)境，與其他鯉科魚類逐漸分化。其中最顯著的差異是鯉科魚類一般含有25條染色體，但是東亞鯉科魚類卻只有24條染色體，這是因?yàn)榕c斑馬魚同源的22號(hào)和10號(hào)染色體發(fā)生了融合。鰱魚、鳙魚的分化時(shí)間大概為360萬(wàn)年以前，是兩個(gè)獨(dú)立物種，但具有非常近的親緣關(guān)系。群體基因組學(xué)分析檢測(cè)到從鳙魚到鰱魚的基因滲入，證明這兩個(gè)近緣物種之間可能存在自然雜交現(xiàn)象。同時(shí)，研究人員檢測(cè)物種分化的區(qū)域，主要和生殖過(guò)程和早期雌性發(fā)育相關(guān)，這些區(qū)域可能影響了兩個(gè)物種早期的物種分化，生殖隔離和環(huán)境適應(yīng)。

水生所副研究員楊連東、博士甘小妮及深圳華大基因股份有限公司副研究員簡(jiǎn)建波、高級(jí)分析工程師吳斌為論文共同第一作者，何舜平為論文通訊作者。該研究工作獲得了中科院戰(zhàn)略重點(diǎn)研究項(xiàng)目和國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助和支持。

（來(lái)源：中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所）