中國(guó)破譯對(duì)蝦基因組并獲國(guó)際首個(gè)高質(zhì)量對(duì)蝦基因組參考圖譜

    (對(duì)蝦基因組重測(cè)序。中科院海洋所提供)

中新網(wǎng)青島1月22日電 (記者 楊兵 胡耀杰)中科院海洋所22日發(fā)布消息稱，該所相建海和李富花研究組主導(dǎo)，與國(guó)內(nèi)外多家單位共同合作，歷時(shí)十年成功破譯了凡納濱對(duì)蝦基因組，獲得世界上首個(gè)高質(zhì)量的對(duì)蝦基因組參考圖譜，為甲殼動(dòng)物研究及對(duì)蝦基因組育種和分子改良提供了重要理論支撐。

據(jù)介紹，甲殼動(dòng)物和昆蟲是節(jié)肢動(dòng)物門中的兩大門類，已有超過6萬(wàn)種甲殼動(dòng)物被報(bào)導(dǎo)。十足目甲殼動(dòng)物囊括了大量重要的水產(chǎn)經(jīng)濟(jì)物種，如蝦、蟹、龍蝦等，而凡納濱對(duì)蝦(Litopenaeus vannamei)作為四大養(yǎng)殖蝦類之首，其年產(chǎn)量達(dá)416萬(wàn)噸，具有非常重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。然而，由于種質(zhì)資源匱乏，中國(guó)對(duì)蝦養(yǎng)殖單位每年需從國(guó)外大量引進(jìn)。

凡納濱對(duì)蝦基因組圖譜。中科院海洋所提供

對(duì)蝦基因組是世界上公認(rèn)的高復(fù)雜基因組，阻礙了多個(gè)國(guó)際科研機(jī)構(gòu)的研究步伐。在該研究中，科研人員嘗試了從一代到三代的各種測(cè)序平臺(tái)以及各種組裝軟件，通過分析發(fā)現(xiàn)，以1-6堿基為單位多次重復(fù)的簡(jiǎn)單串聯(lián)序列(SSR)占對(duì)蝦基因組的23.93%以上，是目前已測(cè)基因組物種中含量最高的，這也是對(duì)蝦基因組高復(fù)雜性的根本原因。

據(jù)悉，對(duì)蝦基因組的發(fā)表為甲殼動(dòng)物底棲適應(yīng)和蛻皮等研究提供了重要的理論基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)支撐，同時(shí)也為對(duì)蝦基因組育種和分子改良工作提供了重要的基礎(chǔ)平臺(tái)。該研究得到國(guó)家863計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、青島海洋科學(xué)與技術(shù)試點(diǎn)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室“藍(lán)色生命”以及實(shí)驗(yàn)室海洋生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室重大成果支持計(jì)劃等項(xiàng)目資助。