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太平洋鮭套式病毒(PsNV)的發(fā)現(xiàn)是否意味著冠狀病毒能感染三文魚?

發(fā)表時間:2020/06/19 22:28:41  來源:中國漁業(yè)報  瀏覽次數(shù):2476  
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1. 新冠病毒能感染那些物種?

目前,病毒、微生物和動植物都采用“域、界、門、綱、目、科、屬、種、株”這樣的分類層次,具體種類上某些層次可能缺失,各層次之間也可能還有“超”和“亞”的中間層次。

一種病毒的宿主存在一個特定的物種范圍,這個宿主范圍與病毒和宿主的分類是有關(guān)系的。而且這個宿主范圍在一定的分類層次上相當穩(wěn)定和有規(guī)律,通常同種不同基因型的病毒有相同或高度相近的宿主范圍,同屬不同種的病毒可能有相近或交叉的宿主范圍,同科不同屬的病毒則在宿主范圍上可能相近也可能有較大差別。不考慮蟲媒病毒這類特定傳播方式的病毒,一種病毒能感染的宿主范圍通常在分類學上也有一定相關(guān)性,宿主范圍窄的病毒可能只能感染一個到幾個同屬的近緣物種,宿主范圍寬的則可能感染跨目到跨綱的物種,但在很寬的分類范圍中,具體易感的物種又有一定選擇性。

根據(jù)ICTV (國際病毒分類委員會)冠狀病毒分類研究小組的最新分類方案,新冠病毒與SARS病毒是同一個病毒種的不同株,屬于套式病毒目(Nidovirales)、冠狀病毒科(Coronaviridae)、正冠狀病毒亞科(Orthocoronavirinae)、乙冠狀病毒屬(Betacoronavirus)。在正冠狀病毒亞科下有甲乙丙丁四個冠狀病毒屬,全部都只感染哺乳類和鳥類恒溫動物。其中乙冠狀病毒屬的成員的宿主范圍主要包括牛、馬、豬、鼠、蝙蝠、果子貍、貓、人等哺乳類,已證明的新冠病毒的宿主包括人、猴、蝙蝠、果子貍、雪貂、貓等,這些分別屬于哺乳綱真獸亞綱的靈長目、翼手目、食肉目等。而豬的細胞受體ACE2能與新冠病毒的S蛋白結(jié)合,但不會感染新冠病毒;狗、鼠的細胞受體ACE2不會與新冠病毒發(fā)生結(jié)合。

2. 太平洋鮭中發(fā)現(xiàn)的套式病毒的背景是什么樣的情況?

加拿大英屬哥倫比亞大學等的研究團隊吉迪恩·莫迪凱(Mordecai G.J.)等人(2019)在eLIFE發(fā)表的“瀕臨滅絕的野生鮭魚被新發(fā)現(xiàn)的病毒感染”(Endangered wild salmon infected by newly discovered viruses)的文章,這篇文章報道了在加拿大水產(chǎn)養(yǎng)殖管理處和鮭增殖計劃(Fisheries and Oceans, Canada Aquaculture Management Division and Salmon Enhancement Program)實施中,從加拿大南部溫哥華島(Vancouver Island)沿岸的太平洋鮭的樣品進行宏轉(zhuǎn)錄組測序,檢測到了三種新病毒。其中一個病毒被命名為太平洋鮭套式病毒(Pacific salmon nidovirus, PsNV)與姬蛙勒托病毒1 (Microhyla letovirus 1, MLeV1)有一定相似性。PsNV主要在太平洋鮭的增殖育苗場和養(yǎng)殖及部分野生的大鱗大馬哈魚中檢出。

MLeV1是趙蘭英(音譯)等2014年從成都的稻田中捕捉的姬蛙樣品中用宏基因組學方法經(jīng)英、荷、中、美團隊聯(lián)合鑒定到的一個新的病毒。根據(jù)2019年的最新冠狀病毒科的分類方案,MLeV1在分類上屬于套式病毒目、冠狀病毒科、勒托病毒亞科(Letovirinae)、甲勒托病毒屬(Alphaletovirus)的成員。PsNV與MLeV1從進化樹上來看分類差距也很遠,可能屬于不同屬甚至不同亞科的成員,分類地位未定。

3. 大西洋鮭套式病毒對人的健康有風險嗎?

吉迪恩·莫迪凱等的論文根據(jù)進化關(guān)系對PsNV與冠狀病毒SARS-CoV和MERS-CoV進行了比較,并用PsNV感染鰓聯(lián)系到SARS和MERS感染呼吸系統(tǒng)。這里作者的討論有些牽強,因為鰓和肺是不同的組織起源,而且感染哺乳類的冠狀病毒也不都是只以肺為主要靶器官。但即便如此,作者所有這些討論均只是就PsNV感染魚的特征進行,提示PsNV對太平洋鮭等的致病作用可能在野生魚類種群動態(tài)中發(fā)揮的影響,還可能對水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)構(gòu)成的威脅。沒有明示或暗指任何PsNV感染哺乳類包括人的風險,也沒有假想SARS或MERS等冠狀病毒能感染魚類,說明作者是嚴謹?shù)貒@結(jié)果及事實開展科學討論。

4. PsNV和MLeV1與感染哺乳動物的冠狀病毒遺傳關(guān)系怎么樣?

我們參與了國際病毒分類委員會(ICTV)對桿套病毒科(Roniviridae)和虹彩病毒科(Iridoviridae)這兩個科的病毒分類。桿套病毒科也屬于套式病毒目的一個科,其成員包括感染蝦類的黃頭病毒1、鰓聯(lián)病毒(原黃頭病毒2)和我們發(fā)現(xiàn)的頭甲病毒1 (原黃頭病毒8),在討論蝦類黃頭病毒這一類病毒時,專家不會將其風險與同目下的冠狀病毒科相聯(lián)系,因為這個遺傳關(guān)系實在是太遠。ICTV目前對非反轉(zhuǎn)錄的RNA病毒的分類只以依賴核糖核酸的核糖核酸聚合酶(RdRp)的氨基酸序列的同源性為依據(jù),因為非反轉(zhuǎn)錄的RNA病毒都有這個共同的基因,才能進行遠緣遺傳關(guān)系的比較。由于不對基因組上的其它非共有基因進行比較,因此RNA病毒的遺傳關(guān)系樹所反映出的遺傳關(guān)系比實際的遺傳差異大大拉近了。在被大大拉近的遺傳關(guān)系樹上,PsNV和MLeV1與新冠病毒的分類地位也相去甚遠,其實際的遺傳關(guān)系則更是風馬牛不相及。用演化的時間來說的話,可能會涉及成千上萬年的演化。

5. PsNV的發(fā)現(xiàn)是否為冠狀病毒感染三文魚提供證據(jù)

當前的語境下,對公眾說冠狀病毒時,其很大的潛在含義是指新冠病毒,即便不是明確指新冠病毒,也是指與此密切相關(guān)的乙冠狀病毒屬,起碼也是感染哺乳類的正冠狀病毒亞科的病毒。從這個意義上來說,PsNV的發(fā)現(xiàn)其實是為新冠病毒不能感染三文魚提供了證據(jù)。因為大自然中能找到的感染這類魚類的與新冠病毒最近的病毒就是PsNV了,而其還與新冠病毒的遺傳距離還相差甚遠。

有人根據(jù)PsNV感染太平洋鮭,它屬于冠狀病毒科,因此推測新冠病毒有可能感染魚類。這樣的推理就像是在說“山羊喜歡攀巖,它是??苿游?,所以奶牛喜歡攀巖”一樣,這個推理是一種顛倒的三段論,顯然違背了邏輯常識。

6. 是否能用PsNV來說加拿大的魚類存在冠狀病毒感染?

PsNV雖然是從加拿大的太平洋鮭鑒定到的新病毒,但我們沒有對我國是否存在這個病毒進行過篩查,而且PsNV與我國成都稻田姬蛙中發(fā)現(xiàn)的MLeV1有類似地位的親緣關(guān)系,這兩種病毒都與感染哺乳類的冠狀病毒相去甚遠,用這個事例來炒作新冠病毒與水生動物之間的關(guān)系不僅違背病毒學原理和科學的邏輯常識,對我國水產(chǎn)業(yè)的發(fā)展也可能造成巨大損害。

7. 太平洋鮭是三文魚嗎?與大西洋鮭有什么關(guān)系?

由于三文魚不是一個學術(shù)名稱,而是商業(yè)名稱,不同的商業(yè)環(huán)境下可能所指的范圍不一樣,因此在很多場合下,也能跟大西洋鮭一樣,稱為三文魚。但太平洋鮭與挪威、智利等的大西洋鮭不是同一個物種,前者屬于大馬哈魚屬(Oncorhynchus spp.),后者屬于鮭屬(Salmo spp.)。

8. PsNV的發(fā)現(xiàn)對我國有什么意義?

近年來的國內(nèi)外研究不斷從水生動物中發(fā)現(xiàn)新的對于水生動物具有致病性的新病毒,這些新發(fā)現(xiàn)的病毒對于我國的水生動物健康存在風險,因此水生動物衛(wèi)生領(lǐng)域依然值得對這些新的病毒加以關(guān)注。

作者:黃倢

亞太水產(chǎn)養(yǎng)殖中心網(wǎng) 總干事

中國水產(chǎn)科學研究院黃海水產(chǎn)研究所 客座研究員

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