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水生所聯(lián)合華大揭示：四大家魚(yú)之鰱鳙進(jìn)化史
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日前，中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所何舜平研究員團(tuán)隊(duì)聯(lián)合華大基因等多家單位在英國(guó)期刊《Molecular Ecology Resources》在線發(fā)表研究論文。該研究利用短讀長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)，結(jié)合遺傳圖譜輔助掛載染色體的組裝策略，獲得連續(xù)性較好、準(zhǔn)確度高的染色體水平的鰱魚(yú)和鳙魚(yú)基因組，同時(shí)對(duì)鰱魚(yú)20個(gè)野生樣本（珠江7個(gè)，黑龍江4個(gè)，長(zhǎng)江9個(gè)），鳙魚(yú)22個(gè)野生樣本（珠江8個(gè)，黑龍江4個(gè)，長(zhǎng)江10個(gè)）進(jìn)行群體重測(cè)序分析，揭示了東亞鯉科魚(yú)類(lèi)的進(jìn)化歷史，并進(jìn)一步探討了鰱魚(yú)、鳙魚(yú)物種形成和群體分化的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。
研究人員介紹，四大家魚(yú)（青魚(yú)、草魚(yú)、鰱魚(yú)和鳙魚(yú)）由于棲息習(xí)性不同，能充分利用整個(gè)生活空間的天然餌料和水域分層，互不干擾，很適合混養(yǎng)在一個(gè)池塘里，同時(shí)具有生長(zhǎng)快、產(chǎn)量高等優(yōu)勢(shì)，因此成為我國(guó)傳統(tǒng)的養(yǎng)殖魚(yú)類(lèi)。直到今天，這四種魚(yú)仍是我國(guó)乃至全世界淡水養(yǎng)魚(yú)的主體魚(yú)，每年產(chǎn)量占我國(guó)淡水養(yǎng)殖魚(yú)類(lèi)的一半以上。
然而這些統(tǒng)稱(chēng)亞洲鯉的魚(yú)類(lèi)作為中國(guó)暢銷(xiāo)美食的同時(shí)，在美國(guó)卻泛濫成災(zāi)。上個(gè)世紀(jì)70年代，美國(guó)很多水域都會(huì)出現(xiàn)雜草和寄生蟲(chóng)，便從我國(guó)引進(jìn)了不少鰱魚(yú)、鳙魚(yú)等來(lái)解決這些麻煩，但是由于沒(méi)有天敵，又不是當(dāng)?shù)氐氖秤敏~(yú)類(lèi)，演變成入侵物種泛濫成災(zāi)。
鰱魚(yú)、鳙魚(yú)是典型的東亞特有鯉科魚(yú)類(lèi)，是我國(guó)最大的經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)養(yǎng)殖群體，為我國(guó)提供了大量的優(yōu)質(zhì)水產(chǎn)蛋白資源。何舜平研究員團(tuán)隊(duì)聯(lián)合華大基因等多家單位發(fā)表的論文，結(jié)合短讀長(zhǎng)組裝和群體重測(cè)序技術(shù)，研究了鰱魚(yú)、鳙魚(yú)兩個(gè)基因組和多個(gè)野生群體，重點(diǎn)關(guān)注東亞鯉科魚(yú)類(lèi)的進(jìn)化歷史與染色體改變、物種形成與群體多樣性、基因功能與環(huán)境適應(yīng)等內(nèi)容。該研究具有重要的意義，不但對(duì)鰱魚(yú)和鳙魚(yú)的基因組進(jìn)行了高質(zhì)量的測(cè)序組裝，并為新品種開(kāi)發(fā)打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)，對(duì)全國(guó)各大水系的鰱魚(yú)和鳙魚(yú)開(kāi)展了比較種群基因組學(xué)研究, 為遺傳育種提供豐富的種質(zhì)資源數(shù)據(jù)，而且也為物種形成、分化、環(huán)境適應(yīng)及物種入侵的科學(xué)研究提供參考模型。
研究人員介紹，四大家魚(yú)（青魚(yú)、草魚(yú)、鰱魚(yú)和鳙魚(yú)）由于棲息習(xí)性不同，能充分利用整個(gè)生活空間的天然餌料和水域分層，互不干擾，很適合混養(yǎng)在一個(gè)池塘里，同時(shí)具有生長(zhǎng)快、產(chǎn)量高等優(yōu)勢(shì)，因此成為我國(guó)傳統(tǒng)的養(yǎng)殖魚(yú)類(lèi)。直到今天，這四種魚(yú)仍是我國(guó)乃至全世界淡水養(yǎng)魚(yú)的主體魚(yú)，每年產(chǎn)量占我國(guó)淡水養(yǎng)殖魚(yú)類(lèi)的一半以上。
然而這些統(tǒng)稱(chēng)亞洲鯉的魚(yú)類(lèi)作為中國(guó)暢銷(xiāo)美食的同時(shí)，在美國(guó)卻泛濫成災(zāi)。上個(gè)世紀(jì)70年代，美國(guó)很多水域都會(huì)出現(xiàn)雜草和寄生蟲(chóng)，便從我國(guó)引進(jìn)了不少鰱魚(yú)、鳙魚(yú)等來(lái)解決這些麻煩，但是由于沒(méi)有天敵，又不是當(dāng)?shù)氐氖秤敏~(yú)類(lèi)，演變成入侵物種泛濫成災(zāi)。
鰱魚(yú)、鳙魚(yú)是典型的東亞特有鯉科魚(yú)類(lèi)，是我國(guó)最大的經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)養(yǎng)殖群體，為我國(guó)提供了大量的優(yōu)質(zhì)水產(chǎn)蛋白資源。何舜平研究員團(tuán)隊(duì)聯(lián)合華大基因等多家單位發(fā)表的論文，結(jié)合短讀長(zhǎng)組裝和群體重測(cè)序技術(shù)，研究了鰱魚(yú)、鳙魚(yú)兩個(gè)基因組和多個(gè)野生群體，重點(diǎn)關(guān)注東亞鯉科魚(yú)類(lèi)的進(jìn)化歷史與染色體改變、物種形成與群體多樣性、基因功能與環(huán)境適應(yīng)等內(nèi)容。該研究具有重要的意義，不但對(duì)鰱魚(yú)和鳙魚(yú)的基因組進(jìn)行了高質(zhì)量的測(cè)序組裝，并為新品種開(kāi)發(fā)打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)，對(duì)全國(guó)各大水系的鰱魚(yú)和鳙魚(yú)開(kāi)展了比較種群基因組學(xué)研究, 為遺傳育種提供豐富的種質(zhì)資源數(shù)據(jù)，而且也為物種形成、分化、環(huán)境適應(yīng)及物種入侵的科學(xué)研究提供參考模型。
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